Разделение фрагментов ДНК

Разделение фрагментов проводят методом электрофореза в полиакриламидном или агарозном геле. ДНК содержит отрицательно заряженные фосфатные группы, и поэтому в электрическом поле фрагменты перемещаются в направлении положительного электрода.

Скорость перемещения зависит от размера фрагмента: чем меньше размер, тем быстрее движется фрагмент. При определенных условиях удается разделять фрагменты, различающиеся по длине только на один нуклеотид. Специальные методы окрашивания позволяют сделать видимыми зоны (полосы) разделенных фрагментов